A história passa-se no Colégio Cross, um internato de prestígio que divide os alunos em dois grupos: A Day Class [Classe do Dia], cujos alunos são humanos e todos usam uniformes escuros, e a Night Class [Classe da Noite], constituído apenas por vampiros e todos usam uniformes claros. O objectivo do colégio é promover a convivência pacífica entre ambas as espécies. A maior parte da sociedade humana não sabe da existência de vampiros e os únicos da Day Class que sabem são, Yuuki Cross/Kurosu e Zero Kiryuu, que lhes foram dado os cargos de Monitores que na verdade actuam como Guardiões do Colégio, para garantir que os da Night Class cumpram as regras. Yuuki não possui memória alguma antes dos seus 5 anos de idade, a sua única lembrança mais antiga é a de Yuuki acredita, assim como o seu pai, que a maioria dos Vampiros são bons e que podem conviver amigavelmente com os humanos, ao contrário do seu parceiro, Zero, que odeia Vampiros e dúvida da concretização desse sonho pacifista.
Há 26 anos atrás, numa classe do terceiro ano do colégio, uma estudante chamada Misaki era a mais popular e adorada do colégio por causa da sua beleza e da sua qualidade nos desportos. Porém um dia Misaki acabou por morrer e como homenagem, os seus amigos decidem “fingir” que ela está viva com eles até o dia da formatura. Anos depois, na primavera de 1998, um rapaz chamado Sakakibara Kouichi muda-se para a cidade e começa a estudar nessa mesma escola. Lá ele encontra todos os alunos rodeados por uma estranha atmosfera, principalmente uma estudante chamada Mei Misaki. Porém Kouichi não esperava que a Misaki da sua sala tivesse mais relações do que o esperado com a história do passado do colégio.
É um anime complicado de perceber, tem de se estar com muita atenção e ir raciocinando o que se está a passar. Mesmo no final ainda nos deixar a pensar e a encaixar tudo.
- Mirai Nikki (Future Diary)
Yukiteru Amano, é um rapaz que tem problemas em fazer amigos. Ele pensa em si mesmo como um observador e escreve tudo o que ele vê num diário do telemóvel. Atormentado pela solidão, Yukiteru começou a imaginar coisas como um amigo chamado Deus Ex Machina, que aparentemente é o Senhor do Tempo e do Espaço. Vendo o estado miserável de Yukiteru, Deus dá-lhe uma nova habilidade. O seu diário vai registar eventos que irão acontecer num futuro próximo. Yukiteru é então forçado a participar num jogo constituído por 12 jogadores em que cada um tem o tão chamado diário do futuro, sendo cada único, no qual o vencedor será o sucessor de Deus.
